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重庆市潼南中学办学历史潼南中学始源于清道光十三年(1833年)，其前身为“鉴亭书院”;书院因附近的大佛寺旁有宋人魏了翁读书台“鉴亭”而得名。
清光绪二十九年(1903年)废科举、办学堂，鉴亭书院改为初等小学堂。
清光绪三十二年(1906年)，升为高等小学堂。
民国三年，学校更名为“潼南县高等小学校”。
民国十三年(1924年)，县教育会云议倡设初级中学，县知事范志文聘任杨鼎新为筹备主任，是年9月，正式开办，定名“潼南县初级中学校”，校址设在鉴亭书院(原高等小学堂迁移镇内)，当年招收新生100人。
民国十四年(1925年)，获省教厅立案。
民国三十四年(1945年)，学校开始增设高中班。
民国三十七年(1948年)，四川省文教厅批准更名为“潼南县立中学校”。至1949年冬止，潼南中学共招初中生42届，毕业37届;高中共招生10届，毕业5届。
1950年4月，潼南县立女中和私立潼光中学并入潼南中学。
1951年10月，学校恢复校长负责制。1951年12月26日，中国教育工会潼南中学委员会正式成立。
1953年，四川省教育厅批准定名为四川省潼南中学。至“文革”初期止，潼南中学初中毕业共51个班，约2500人;高中毕业35个班，约1700人。高中升大学比例为50%左右。
1966年6月，“文革”开始。
1970年1月，潼南中学“革委会”成立;6月，潼南中学开始复课。
1973年10月22日，学校出版校报《学习生活》。
1978年12月，党的十一届三中全会召开。此时，中国教育工会潼南中学工会得以恢复。1982年2月，学校被四川省人民政府命名为重点中学。
重庆成为直辖市后，学校于1998年更名为重庆市潼南中学校。
1999年，重庆市人民政府确认潼南中学为重庆直辖市首批重点中学。
2000年10月，潼南师范学校合并入潼南中学。
2009年，潼南县政府收购原私立翰林中学，并于2010年2月交付潼南中学使用，成立“潼南中学江北校区”。
2024年，潼南中学校被命名为重庆市艺术特色学校。
2024年7月11日，以潼南中学校江北校区为校址，设初中部、高中部，成立“重庆市潼南第二中学校”。潼南中学校保留老校区，不设初中部，只办高中。
