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学校现有国家级国际联合研究中心、国家级国际科技合作基地、辽宁省高校重大科技平台、辽宁省重点实验室、辽宁省转化医学研究中心等科技平台30余个。“十二五”期间，学校承担国家、省部级科研课题670余项，其中863计划课题、973计划课题、国家重大科技专项课题、国家自然科学基金项目310余项;以大连医科大学为完成单位的通讯或第一作者发表SCI论文1758篇，进入ESI高被引论文12篇。获得省部级以上科技奖励65项，申请发明专利88项。主办《大连医科大学学报》、《医学与哲学》、《中国微生态学杂志》3种学术期刊。

学校为国家首批“卓越医生教育培养计划”项目试点单位，现有国家级特色专业建设点3个，综合改革试点专业1个，人才培养模式创新实验区1个，大学生校外实践教育基地2个，实验教学示范中心2个，教学成果奖4项，双语教学示范课程1门。